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隨著微生物技術的不斷發展，傳統的廢水生物處理方法已經不能順應現代工業企業生產以及人們生活的需要。這就需要相關部門結合微生物研究的新理論，融合新技術制定廢水生物處理的新方法，下面簡略介紹廢水生物處理的新方法。

1、微生物有機凝聚劑

在廢水處理中，凝聚劑的加入能夠有效提高廢水污染物的去除率，但由于有機高分子合成的凝聚劑價格昂貴，很多企業在生產中并沒有應用有機凝聚劑。但微生物有機凝聚劑的出現改變了有機凝聚劑價格昂貴和存在影響人們身體健康的現狀。微生物有機凝聚劑是由微生物產生的代謝產物包括糖蛋白、多糖等產物，并且利用微生物技術，通過細菌、真菌等微生物發酵、提取、精制而得到的，是具有生物分解性和安全性的新型、高效的水處理劑。通過新型的微生物有機凝聚劑進行污水處理，有效地處理污水中的有機物，凈化水系統。

2、生物過濾法

生物過濾法也稱生物膜法，是利用固著于固體介質表面的微生物來凈化污染物。在廢水處理中，生物膜是循環形成的。生物膜表面吸附著一層薄污水，稱為結合水層，并在外層有自由流動的污水，被稱為運動水層。當生物膜將污水中的有機物進行吸附、吸收、氧化分解時，附著水層中的有機物濃度也隨之減少，并且在移動過程中，微生物所需的氧氣也沿空氣、運動水層、結合水層進入生物膜內，而膜內的微生物分解的有機物則移出膜外。通過這種生物過濾法，將廢水中的污染物通過生物膜吸入分解并排出膜外，有效地凈化水中污染物，促進水資源的循環利用。

3、固定化微生物技術

固定化微生物技術起源較晚，是利用物理或者化學手段將游離生物細胞定位于限定的空間區域并使其保持活性反復利用。該技術分為交聯法、并價結合法、吸附法和包埋法。將該技術應用到高濃度廢水處理中，除污效率高，固液分離效果好，環境耐受力強，是很好的廢水處理技術。